退役军人档案管理系统在保证数据安全方面采取了多种措施，以确保退役军人的个人信息和军事秘密得到妥善保护。

以下是一些主要的数据安全措施：

1. 先进的安全技术

加密技术：系统使用SSL网络加密传输、数字证书、电子印章、USBKey加密锁等安全策略，对传输中的数据进行加密，防止数据在传输过程中被窃取或篡改。

强密码策略：系统要求用户设置复杂密码，并通过定期更换密码、密码锁定机制等方式，增加密码破解的难度。

访问控制：系统采用与用户工作职能相适应的权限体系进行多维度授权，区分阅读条目与内容权限，确保只有授权用户才能访问相关数据。

2. 数据存储和备份

安全存储：系统支持数据库存储和文件服务器存储，同时支持本地、网络和FTP存储，确保数据的多重备份和容灾能力。

加密存储：系统对存储的数据进行加密处理，防止数据在存储过程中被非法访问或泄露。

定期备份：系统定期自动进行数据备份，并支持手动备份功能，确保数据在发生意外情况时能够迅速恢复。

3. 安全审计和监控

操作监控：系统利用用户登录监控、应用操作行为监控、工作流程监控等方式，实时记录用户的操作行为，确保所有操作都可追溯。

黑匣子记录：系统类似于黑匣子的操作痕迹记录功能，可以详细记录用户的每一步操作，为事后审计提供有力证据。

数据分析：系统对监控信息进行统计与分析，及时发现潜在的安全隐患和异常行为，并采取相应的措施进行处理。

4. 法律法规和内部管理

遵守法律法规：系统在设计和使用过程中严格遵守国家相关法律法规，如《个人信息保护法》、《网络安全法》等，确保数据的合法性和合规性。

内部管理：加强内部管理，制定完善的数据安全管理制度和操作流程，确保工作人员在操作过程中严格遵守规定，不泄露任何敏感信息。

5. 模块化设计和可扩展性

模块化设计：系统采用模块化设计，可以根据实际需求进行定制和扩展，同时支持与其他系统的集成和数据共享，提高系统的灵活性和可扩展性。

技术升级：随着技术的不断发展，系统会定期进行技术升级和更新，以应对新的安全威胁和挑战。

综上所述，退役军人档案管理系统在保证数据安全方面采取了多种措施，从技术、管理、法律等多个层面入手，确保退役军人的个人信息和军事秘密得到妥善保护。